Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg13Q91YI1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg13Q91YI1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg13Q91YI1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg13Q91YI1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg13Q91YI1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg13Q91YI1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg13Q91YI1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg13Q91YI1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg13Q91YI1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg13Q91YI1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg13Q91YI1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg13Q91YI1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms