Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms