Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Z5

Cacnb1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb1Q8R3Z5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacnb1Q8R3Z5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb1Q8R3Z5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb1Q8R3Z5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms