Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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Vmn1r200Q8R281 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Vmn1r200Q8R281 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Vmn1r200Q8R281 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Vmn1r200Q8R281 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Vmn1r200Q8R281 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Vmn1r200Q8R281 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Vmn1r200Q8R281 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r200Q8R281 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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