Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b4Q8QZY9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3b4Q8QZY9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b4Q8QZY9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b4Q8QZY9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms