Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Brd3Q8K2F0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brd3Q8K2F0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brd3Q8K2F0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brd3Q8K2F0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms