Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnma3Q8JZW8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnma3Q8JZW8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pnma3Q8JZW8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnma3Q8JZW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms