Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ago4Q8CJF8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ago4Q8CJF8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ago4Q8CJF8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ago4Q8CJF8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago4Q8CJF8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ago4Q8CJF8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms