Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpc3Q8CFZ4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc3Q8CFZ4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc3Q8CFZ4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms