Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc3Q8CCH2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms