Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo48Q8CAT8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo48Q8CAT8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms