Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa22Q8C1N8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa22Q8C1N8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms