Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp38Q8BW70 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp38Q8BW70 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp38Q8BW70 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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