Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PcgF3Q8BTQ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PcgF3Q8BTQ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PcgF3Q8BTQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PcgF3Q8BTQ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PcgF3Q8BTQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms