Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH88

Depdc1b, DEP domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc1bQ8BH88 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Depdc1bQ8BH88 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Depdc1bQ8BH88 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Depdc1bQ8BH88 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms