Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim6Q8BGE7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim6Q8BGE7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim6Q8BGE7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms