Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sestd1Q80UK0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sestd1Q80UK0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sestd1Q80UK0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sestd1Q80UK0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms