Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnf1Q7TSH7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnf1Q7TSH7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms