Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h4Q6ZPZ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 498 ms