Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nudcd1Q6PIP5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms