Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sort1Q6PHU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sort1Q6PHU5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sort1Q6PHU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms