Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrp12Q6P5B0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrp12Q6P5B0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrp12Q6P5B0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Rrp12Q6P5B0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp12Q6P5B0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrp12Q6P5B0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms