Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Szrd1Q6NXN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms