Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Knl1Q66JQ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Knl1Q66JQ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Knl1Q66JQ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Knl1Q66JQ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms