Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vil1Q62468 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vil1Q62468 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.5 ms