Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Taf6Q62311 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf6Q62311 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf6Q62311 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms