Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh1a2Q62148 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a2Q62148 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 387.4 ms