Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phox2aQ62066 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phox2aQ62066 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phox2aQ62066 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.2 ms