Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctr9Q62018 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctr9Q62018 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctr9Q62018 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms