Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cep250Q60952 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cep250Q60952 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cep250Q60952 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms