Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a4Q60857 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a4Q60857 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a4Q60857 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms