Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A1cfQ5YD48 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A1cfQ5YD48 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A1cfQ5YD48 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A1cfQ5YD48 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A1cfQ5YD48 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A1cfQ5YD48 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A1cfQ5YD48 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A1cfQ5YD48 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A1cfQ5YD48 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A1cfQ5YD48 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms