Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc5a6Q5U4D8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc5a6Q5U4D8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc5a6Q5U4D8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms