Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv4Q5R1A3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trdv4Q5R1A3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms