Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spsb3Q571F5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spsb3Q571F5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spsb3Q571F5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms