Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1qtnf9Q4ZJN1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms