Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc55Q3UY51 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc55Q3UY51 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc55Q3UY51 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc55Q3UY51 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms