Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr1d1Q3UV55 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr1d1Q3UV55 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1d1Q3UV55 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms