Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Eif3j1Q3UGC7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3j1Q3UGC7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3j1Q3UGC7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3j1Q3UGC7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms