Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm45902Q3UDN3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm45902Q3UDN3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm45902Q3UDN3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm45902Q3UDN3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms