Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c3Q3TMP1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf3c3Q3TMP1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms