Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pde12Q3TIU4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde12Q3TIU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms