Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul4aQ3TCH7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul4aQ3TCH7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms