Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col24a1Q30D77 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col24a1Q30D77 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col24a1Q30D77 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col24a1Q30D77 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col24a1Q30D77 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms