Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbp8Q2V6D6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp8Q2V6D6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms