Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtel1Q0VGM9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtel1Q0VGM9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtel1Q0VGM9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtel1Q0VGM9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms