Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntnap5cQ0V8T7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntnap5cQ0V8T7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms