Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r181Q0P547 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r181Q0P547 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r181Q0P547 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms