Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf541Q0GGX2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Znf541Q0GGX2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf541Q0GGX2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms