Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gja5Q01231 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gja5Q01231 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gja5Q01231 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms